干旱区研究 ›› 2014, Vol. 31 ›› Issue (6): 1115-1120.

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荒漠长耳跳鼠肠道菌群多样性初探

张哲1,2 ,孔艳1,2,尹彦强1,2,刘斌1   

  1. (1.中国科学院新疆生态与地理研究所,荒漠与绿洲生态国家重点实验室,新疆 乌鲁木齐 830011; 2.中国科学院大学,北京 100049)
  • 出版日期:2014-11-11 发布日期:2014-11-25

Initial Analysis of the Intestinal Bacteria Diversity in Desert Euchoreutes naso

  • Published:2014-11-11 Online:2014-11-25

摘要: 长耳跳鼠[WTBX](Euchoreutes naso)[WTBZ]是世界自然保护联盟定义的濒危物种,对长耳跳鼠进行研究和保护极为重要,特别是其肠道微生物多样性的研究对该物种有极大的保护价值。通过提取粪便样品总DNA,构建16S rRNA文库,基于核苷酸片段多态性的分析方法,利用内切酶Bsur I对262个克隆子进行酶切分型、测序后得到15种不同的可操作分类单元,对该可操作单元进行基本局部比对工具(basic local alignment search tool,BLAST)比对后,得到梭菌目(Clostridiales)、乳杆菌目(Lactobacillales)、肠杆菌目(Enterobacteriales)、芽孢杆菌目(Bacillales)、拟杆菌目(Bacteroidales)、支原体目(Mycoplasmatales)6个目的细菌种类。